Đến năm Kỷ Sửu (1739), chúa Nguyễn Phúc Khoát khi ngự giá ra Quảng Trị đã ban sắc phong và đặt tên Sắc tứ Tịnh Quang, đánh dấu vai trò quan trọng của chùa đối với Phật giáo Đàng Trong

Vào năm 1997, dưới sự lãnh đạo của Hòa thượng Thích Chánh Liêm, Hòa thượng Thích Phước Châu, chùa được đại trùng tu với kinh phí gần 2 tỷ đồng. Lễ đặt đá khởi công diễn ra vào ngày 26-3-1997 và sau gần 4 năm xây dựng, chùa được khánh thành vào ngày 12-3-2001

Hương án Tổ sư khai sơn tổ đình Sắc tứ Tịnh Quang

Tháp Hòa thượng Thích Ân Cần

Tháp của Hòa thượng Thích Phước Châu được tôn trí tại tổ đình Sắc tứ Tịnh Quang. Lúc sinh thời, khi tỉnh Quảng Trị được tái lập (1990), tại Đại hội Phật giáo tỉnh lần thứ nhất, Hòa thượng Thích Phước Châu được suy cử làm Phó Trưởng ban Thường trực Ban Trị sự kiêm Trưởng ban Hướng dẫn Phật tử tỉnh. Với tâm huyết và sự kiên trì, Hòa thượng đã đóng góp quan trọng trong việc tái thiết tổ đình Sắc tứ Tịnh Quang, biến nơi đây thành trung tâm tu học và sinh hoạt Phật giáo quan trọng của tỉnh. Ngày 26-11-2006 (nhằm ngày 6-10-Bính Tuất), Hòa thượng viên tịch, trụ thế 63 năm, 38 hạ lạp

Tháp Trưởng lão Hòa thượng Thích Trí Hải, Thành viên Hội đồng Chứng minh, trú trì tổ đình Sắc tứ Tịnh Quang từ năm 2007 cho đến ngày viên tịch (26-6-Kỷ Hợi); trụ thế 79 năm, 55 hạ lạp

Với bề dày lịch sử gần 3 thế kỷ, tổ đình Sắc tứ Tịnh Quang đã chứng kiến và đồng hành cùng sự phát triển của Phật giáo Việt Nam qua các thời kỳ, đặc biệt là ở vùng đất Quảng Trị giai đoạn đầy biến động. Đây không chỉ là một di tích lịch sử, mà còn là nơi gửi gắm tâm linh của biết bao thế hệ Phật tử. Với giá trị văn hóa, tâm linh sâu sắc cùng dấu ấn của các bậc danh Tăng, chùa tiếp tục là điểm tựa tinh thần, nơi nuôi dưỡng đời sống tu học và hành trì Phật pháp cho nhiều thế hệ mai sau